（一）首建嘎登寺
（二）造隐语诗
（三）嘎登寺开光
（四）消灾延寿
（五）为藏王之弟授比丘戒
（六）根敦主巴谒见大师
（七）绛阳却结建哲绷寺
（八）一天之中理头发二十一次
（九）著菩提道次第略论
（十）兴建广严殿
（十一）广转时轮密法
（十二）著述入中论善显密意疏
（十三）释迦也协建色惹寺
《宗喀巴大师应化因缘集》
（一）首建嘎登寺
由于环绕在大师左右的徒众，逐日增多；又因始终无固定讲经的场所，每季法会，师徒们都得像赶场似的东奔西跑，徒生种种疲劳。所以有很多亲近大师的上首弟子和大施主，频频劝大师建安众之处，以作为弘扬大师教法的根本道场。此建议一提出，大家竞相附和随喜，有的愿意将自己的寺院捐出，有的愿意奉献财物兴建道场，情况非常热烈。
大师内心非常高兴，深知兴建道场之因缘已经成熟，但为了除去大众不必要的疑虑，就在大招寺供养法会时，祈祷释迦牟尼佛，看在这一切道场中，哪个地方作为根本道场最为殊胜。祈祷后，又详细观察灯相和梦兆，结果显示出，以离拉萨东五十里旺古尔山（bdang-bskur-ri）旁的大阿兰若最为吉祥。
供养法会圆满后，大师亲自到现场加持地基，并命上首弟子大阿阇黎达玛仁勤（俗称贾曹杰），和持戒最清净的弟子扎巴坚参，率领僧众，遵照大师的嘱咐，创造嘎登寺（此寺全名叫嘎登南结领dga’-ldan-rnam-parrgyal-ba’igling）。
初建时，四方涌来无数僧俗，有的出力，有的施财，所以在一年之内，就建好七十多座院房，一百多座地基。建造房舍的仪轨，完全依照戒经进行。比如建造之前，先堪察地理位置，再向全体僧众宣布，等到征得大众同意之后，才开始动工。又房舍的规格，从大殿到僧舍，乃至厨房，完全符合戒经的规定。因此，由造嘎登寺之事看来，亦可窥见大师致力弘扬戒律之一斑了。
宗喀巴大师创立的黄教（又名黄帽派），名格鲁派，即因此寺得名，意为嘎登寺派。派藏文读鲁，嘎登贝鲁简称嘎鲁，按藏文读音变化的规律，读为格鲁，所以黄教称为格鲁巴。此外又有人说，格鲁派意思是善规派，这种说法是因该寺倡导严守戒律而来的。
又大师一派，得嘎登派之名，早在阿底峡尊者入藏时即已预言。如噶当雷邦第二十六未来授记品中说：“最后正法火，由‘名称’重燃，作无量利乐，斯即‘胜处士’。”
偈中第二句“名称”，是大师出家法号；第四句“胜处士”，指嘎登派。按嘎登，为睹史陀之翻译，即具足喜乐的胜地。
（二）造隐语诗
己丑年夏天，大师应阿喀僧俗之请，赴桑丹领（bsam-gtan-gling）寺，为大众讲授“集密圆满次第”及“五次第论”。讲授完毕，随即闭关，著《集密圆满次第释》。
造释时，大师频频向上师、本尊祈祷，请求加持，因而常感集密文殊金刚现身等瑞相。大师均以隐语诗，将经过情形一一记下。其大意是这样:
己丑年十二月初三的晚上，大师梦见十九尊文殊菩萨的大曼陀罗。文殊菩萨手提净瓶，告诉他说：“这瓶子里的水，是过去阿底峡住那塘吉水边时，和文殊、弥勒两大菩萨，讨论法、报、应三身，以及法、色二身法义所和合的水。从阿底峡到现在，已经有三百多年，一直无法找到托付的人，如今你是最好的人选，我把它交给你。”（这里说瓶水，是讨论三身和二身法义所和合的水，是不了义的说法；事实上是密指把阿底峡尊者的教典、教授、教诫三派传承法义，传授给大师。）
十二月初四的晚上，大师梦见布顿仁波切坐在一张大宝座上，正在为大众传授《集密根本经》。整部经讲完之后，仁波切很慎重地嘱咐大师说：“今后，你就是这部经的主人。”当时大师心想：“这部经后面，到底有没有缺漏?”于是大师把经翻开，从头到尾详细地检查一遍，结果发现整部经完好无缺。后来仁波切双手捧着经，放在大师的头上，口诵灌顶真言，并以手印加持三次。
十二月初五，大师对于噶举派祖师玛尔巴上师，所传之和合修法(睡与死有合修法、梦与中有合修法、醒与生有合修法等无上瑜伽密)，获得坚固不谬的见解。
十二月初六，大师领悟玛尔巴上师所传的这些合修法，就是《集密根本经》和龙树菩萨中观见之正义，并获得决定见。
十二月初七，大师阅读提婆之《菩萨摄行炬论》，生起殊胜的定解。
（三）嘎登寺开光
庚寅年（1410年，大师54岁）年初，嘎登寺寺宇佛像落成。大师于二月初五至嘎登寺，举行开光法会（佛像造成后，择日设供加持，谓之开光），并为大众讲《菩提道次第广论》、《集密月称释》、《五次第》、《集论》、《瑜伽师地论》、《因明论》等。
这年，大师著述《集密四天女请问经释》、《智金刚经集释》，并开始著《五次第释》（这部书，于第二年造成）。
（四）消灾延寿
过去大师住聂地僧格宗时，妙音天女曾现身告诉他说，五十七岁时将有寿难。文殊菩萨也特别嘱咐，叫他在这段期间，专修对治寿难的密法；并说，一旦延寿之后，对众生和正法都大有饶益。
辛卯年（1411），大师五十五岁，他为了事先遮止灾难，于是和三十多位高足，闭关专修大威德金刚密法。每天午前修增益，午后修息灾。
大师和徒众如是精进的修持，直到壬辰年，虽然参加共修的人加至四十多位，却仍然未获得有效遮止寿难的征兆。然而这段期间，大师果真如妙音天女所授记的，证得乐空和合之妙智，引生四种欢喜，和四种空性的功德。
是年秋天，大师见未获遮止之相，深恐明年的灾难，将无法避免，于是对弟子们说：“以种种迹象看来，以后我恐怕无法再继续为你们讲经了。为了祈愿密教大行于世界，今天我想将密部的奥旨，扼要地替你们钩提一下。”
徒众们乍听之下，惶恐万分，深怕因此而失去大依怙，遂殷重至诚地央求大师说：“如今灾难之期，已迫在眉睫，我等祈愿大师慈悲，体念众生失离依怙之若，请暂时放弃讲经，继续专修吧!弟子虽不敏，也愿尽力助修。”
大师因徒众至诚哀请，于是从壬辰年(（412，大师56岁）八月初七，共三十多位弟子，再次住关专修。其他弟子，也各自闭关助修。
十一月中旬，大师的病情逐渐加重。最严重时，竟至二十多天不能入眠。大师病情虽然如此严重，但修持并未因此而中辍，饮食起居，也跟平常人一样，所以徒众根本不知道大师严重的病情，与身内所受的痛苦。
十二月十三日晚上，大师在三摩地中，见到坚固的瑞相，因此很高兴地告诉大众说：“如今吉相已现前，成功在望，大家更应集中心力，猛利修行。”
当时，大阿阇黎达玛仁勤以及全体僧众，一意为大师助修，虽至除夕、新年，仍然不肯中断。其他道俗，也惟恐大师离去，尽力布施培福，供养三宝，祈愿大师住世。
师徒这样不断的修持，至大师五十七岁时，又选出七位具足清净三昧耶戒的弟子，修本尊法；于大威德金刚具有证量的弟子，入室与大师共修。大师白天修大威德密法，晚间则住大乐不空三摩地，以防范非人、妖魔的留难。
于大师教法作逆缘的，总共有四个大魔。数年前，大师在阿喀讲《密宗道次第广论》时，曾降伏一个魔；此魔已立下誓言，绝不再作乱，并安住于三昧耶戒。大师这次闭关时，又有一魔前来投首认罪，请求宽恕，并发重誓，愿永久护持大师的教法。
又有一次，大师和徒众正专心修持时，就在定中，见虚空中有释迦牟尼佛，身金黄色，放大光明，威德巍巍，结大伏魔印。大师以定力迎请，摄入自身中。刹那间，大师对于各种灾难，得大无畏力。这时，见到六臂嘛哈嘎拉和阎罗法王，以金刚索系住一个妖魔的颈子，合力牵到大师的座前，以利刃砍下他的头。就在这个时候，师徒都听到外面有许多非人大喊：“败了！”众妖魔于是作鸟兽散，向十方遁去。
第二天，六臂嘛哈嘎拉又牵来一魔，跟昨天一样，也把他杀了。至今四大魔已消灭殆尽，大师之法体遂逐渐恢复健康。
这时，本尊现身授记说：“今后，你必须勤修生起、圆满两种次第，不久之后，就可证得最究竟位。你弟子中，有七位较具善根的，也将各有所证。”
大师身上所有病乱，于甲午年（大师58岁）六月初五，全部痊愈。
（五）为藏王之弟授比丘戒
乙未年（1415，大师59岁）夏天，大师受藏王扎巴坚参之请，赴闻地札希垛喀寺（bkra-shisdo-kha）安居。为丹萨替寺、孜塘寺等住持，及数百名三藏法师，广转《中论》、《释量论》、《菩提道次第广论》及《入菩提行论》等深广法轮。
由于大师躬弘戒律，戒德清净，因而向大师求戒的人有很多。大师住札希垛喀寺时，也曾应丹萨替寺住持琐南桑布（sbyan-sngabsod-namsbzang-po，1380-1416，藏王胞弟，在此之前，已是大师的弟子）之请，为他正授比丘大戒。
（六）根敦主巴谒见大师
根敦主巴（dge-‘dungrub-pa，1392-1474，义译为僧成），他是目前西藏政教领袖达赖喇嘛的第一世。明太祖二十五年，岁次壬申，生于萨迦寺附近的牧场。父亲名叫“统薄多杰”，母亲名叫“觉摩曩吉”，是牧场的主人。
根敦主巴刚出生的那天晚上，恰逢盗匪来抢劫，他的母亲来不及带走他，遂将他藏在乱石堆间。第二天早晨，众人寻找他时，看见一只老乌鸦在他的旁边守护着，为他防护各种野兽的伤害。众人看到这种情景，都感到很不可思议，说他一定是再来菩萨。
根敦主巴自幼行仪端庄，不作孩童嬉戏。因他家遭受盗匪洗劫，生活非常困苦，所以很小就帮助父母放羊。父亲去世时，他亲手抄药师经，代父回向。十五岁时，礼拏塘寺住持成就慧大师出家，学习各种经论和密法。二十五岁只身到前藏，从茶主寺滚桑巴仁波切学习因明和中论。
乙未年大师住札希垛喀寺时，根敦主巴因深仰大师之学德，于是随侍滚桑巴仁波切往朝大师。
根敦主巴于大师座前，请问许多《释量论》之疑难，并听讲《辨了不了义论》、《中论疏》、《上师五十法颂疏》、《密宗戒疏》等不共深义。他因智慧明利，故深得大师的嘉许。
当时，大师深知根敦主巴，有弘扬戒律的因缘，因而赐他一件穿过的五衣。此后又有一次，根敦主巴为了受持清净戒律，而将前往卓萨寺学戒，临行时大师送他一块金子，作为学戒的顺缘，并称赞他说：“你能以‘愿行持之心’来学戒，真是希有难得。今后你当努力弘扬圣教，令其光显。”
后来根敦主巴亲近宗喀巴大师，和克主杰多年，具得大师之不共教授。丁卯年（447年），依师长及本尊记莂，创建札什伦布寺，摄御大众，讲授大师之清净教法。遂使大师之法雨，普润后藏一切众生。他又著有《戒经疏》、《因缘集》、《正理庄严论》、《释量论疏》（此书，台北佛教书局目前已有流通）等书，盛行于世。
（七）绛阳却结建哲绷寺
绛阳却结（hjam-dbyanschos-rje，义译为妙音法王），法名叫札西贝敦（bkra-shisdpal-ldan，1379-1449），是宗喀巴大师的上首弟子。他记性特佳，如《大般若经》、《宝积经》、《华严经》等，都各造一部笔记；并受持显密经论一百零八部，凡有讲说，不须要经本，直接靠背诵。在大师众弟子中，他是闻持第一。
乙未年，大师住札喜垛喀寺为大众讲经时，有一天，对绛阳却结授记说：“你如果兴建道场，法缘将会比母寺（嘎登寺）和各子寺，更兴盛，更圆满。”
大师说完，又取出从寂灭山（雪山）中开藏所得的法螺，授结绛阳却结，以作广弘正法的瑞应。
（宗喀巴大师过去在释迦牟尼佛的法会上，听佛说：“谁愿意在末法时，住五浊恶世建正法幢？”当时大师虽然尚是童子，听了这句话，马上以一颗水晶球供养佛，发愿前往。释迦牟尼佛很高兴，特地送他一个法螺作为授记，并将法螺藏于雪山中，大师弘法时，才从山中开藏取得。此法螺目前仍然留在嘎登寺，人人可朝。）
绛阳却结接过法螺，心里想：“修学密法一切成就的根本，就是恭敬上师。因此，我应谨遵上师所嘱咐，励力奉行。”
当天晚上，绛阳却结梦见一条大河，河水湍急，河岸挤满无量无边的众生。他们虽极想渡河，却没有任何有效的办法，绛阳却结深生悲悯，于是纵身一扑，双手刚好碰到对岸，他的躯干宛如一座弧形的桥梁。众生因藉他的躯干，而到达彼岸。
翌日，绛阳却结醒来，知道这个梦兆，是表示他将建寺弘法，必能饶益无量众生的瑞相，因此很高兴，立即筹划建寺，四出劝募。于丙申年（1416），以内邬官家南喀桑布为主要施主，动工创建哲绷寺（hbras-spuns）。开工时，大师曾亲临加持地基。
（八）一天之中理头发二十一次
大师住札喜垛喀寺时，有一天，来了一位菩萨化现的塑师，为大师铸塑圣像。
这位塑师，手工极为精巧，塑造圣像之速度又非常快，一天之中，塑大师像二十一尊。这些塑像，栩栩如生，十分酷似大师，连大师见了，都赞叹说：“这些塑像真像我呀!”
为了替这二十一尊“大师圣像”装藏，大师也示现令人无法思议的事，他在同一天中，理头发二十一次。每一尊塑像，装一份头发。这些圣像，至今仍然存在札喜垛喀寺，是大师像中，最具加持力的塑像。
（九）著菩提道次第略论
乙未年秋天，大师自札喜垛喀寺返回嘎登寺后，即抉择一切宗法，著《集密月称释疏》，及《集密决断摄义科判》等书，以显集密之不共胜义（今存大师著述中第四函和第五函）。
又由于大师过去所造的《菩提道次第广论》，文义包含广博，一般少慧有情，难为奉持。因此本尊嘱咐另造略本，以摄受下机，大师遂于广论中择取要义（略去破立教证），造《菩提道次第略论》。
（十）兴建广严殿
大师自从著述《集密月称释疏》，及《集密决断摄义科判》后，就恒常讲演密法，未尝间缺。有一次，大师正在传授密法时，心想：“密续中说，未得密法灌顶的人，以业障未清净故，佛陀制戒不得见密法坛城。如今在大殿中举行密法供养，这是不合密续本意的。为了遵依密宗戒律，应当另外再兴建密法殿才好。”
于是大师开始筹划兴建专修密法之广严殿（在嘎登寺内）。由于大师悲愿之感召，一时四方信施荟萃于此，所供养的物品，多得不可胜计。大殿遂于乙未年奠基，丙申年建成。
丁酉年三月，大师延请精工巧匠铸塑佛像。在广严殿中层，塑造比大招寺稍大的释迦牟尼佛圣像(赤铜镀金)；大殿的上层，各依仪轨，建立“集密三十二尊”、“胜乐六十二尊”、“金刚界”等三大曼陀罗。“集密三十二尊”和“胜乐六十二尊”等曼陀罗中，集密金刚、胜乐轮金刚各用生银一百两；五方佛和诸瑜伽母等圣像，也用生银塑造；其他佛像和宫殿，则用赤铜制造，外表镀金。“金刚界曼陀罗”之主尊，用生银不满百两；其他十二尊佛像，各用生银七十多两；宫殿亦是赤铜镀金。
此外，又铸镀金之文殊菩萨、无量寿佛、大威德金刚等佛像，高约三尺；佛顶尊胜、大白伞盖等佛母像，高约一肘。更以绸缎、香药等材料磨成粉，再捣成泥，塑造大威德金刚佛像，高约十七搩手。全部佛像，都以种种珍宝作为庄严。
圣像于年底全部竣工，大师依照大威德金刚之仪轨广作开光，并聚集无量持戒之僧俗，举行供养法会。开光时，瑞相屡现，都是空前所希有之吉兆。此后卫藏各地，连年风调雨顺，谷物丰稔，国泰民安。这都是兴建广严殿，获得诸佛加持、护法拥护之功德啊!
（十一）广转时轮密法
戊戍年（1418，大师62岁），大师因四方僧侣和原有徒众的劝请，于嘎登寺，为大众广转显密法轮。
法会中，大师特别讲演时轮金刚大法。时轮密法，有许多地方和其他密法不相同，因此一般学者多加破斥。宗喀巴大师则以无垢智慧，了知这是一部最高深、最殊胜的密法。
时轮金刚法，传入西藏有两派，一是月怙论师所传，一是惹法极译师所传。布顿仁波切最初从金刚幢，学习惹法极译师所传之教授，后又从圣光大师学习月怙论师所传之教授，然后将两派之时轮密法传给却吉贝瓦仁波切。却吉贝瓦仁波切专精时轮大法，后来将此大法传给宗喀巴大师。
宗喀巴大师于此法会，大力弘扬时轮密法。此密法遂盛行于西藏，肇基黄教。
（十二）著述入中论善显密意疏
月称论师是七、八世纪中，印度萨曼达国人。他修学无上密法，证得最究竟位，得如幻定，成就任何违缘都无法动摇之殊胜悲智。在佛护论师之下，他是中观派中，最能遣除众生实执，光显龙树菩萨深广理趣的大阿阇黎。（月称论师是中观应成派Prasaingika的创始人。）
《入中论》是月称论师所作。他以菩提心的十种分位，采用《华严经》中的十地名字作为品名，而分别写成十品。其中第六品（占全书三分之二）菩提心现前地中，发挥他独特的见解，广破唯识。他的观点不但不共唯识，即使是解释龙树、提婆意趣的其他中观派，亦有所不同。在西藏，这部《入中论》被视为中观派论著的代表作。
然而这部《入中论》文义深邃，极难通达，因此在戊戍年大师住嘎登寺的时候，首先由善吉祥大善知识，供养大师以四十两银子打造的曼陀罗，复由许多信解《入中论》，慧力殊胜的大善知识，殷诚劝请大师造一部文义浅显，总义明确，并广为解《入中论释》（月称论师造）诸疑难处的大疏。大师因而着手作疏，显彼密意。这部书于此年（1418）圆满完成，取名叫《入中论善显密意疏》（佛教大藏经第148册763页，佛教书局亦有单行本流通）。
（十三）释迦也协建色惹寺
释迦也协（sakyaye-shes，1352-1435，蔡贡塘人）是大师八大清净弟子之一，也是福德和学问最好的弟子。永乐十二年（1414），释迦也协代师晋京，永乐十四年（1416），他自中国京城返回西藏，并将明成祖所赐的佛经、佛像、绸缎、金银宝器、玉石等无量物品，全部供养给宗喀巴大师。
戊戍年（1418），释迦也协遵依大师之嘱咐，于色惹却顶创建色惹寺（大乘洲）。此后，他又陆陆续续修建色惹下院和吉寺。
经过一段时间，藏王大在又重建色惹寺大殿，作为俄果寺（藏王专用的寺），并延请栖让寺（藏王的旧寺）中，所有仁波切和一切僧众，进住此寺。这座俄果寺，就是现在色惹寺之密宗院。
色惹寺藏有许多极为殊胜的法宝。大殿中，有比丘玛巴摩（义译为华比丘尼）所供奉的惹钦观音圣像，非常灵异。
［比丘玛巴摩，本来是藏王的女儿。她长得明眸皓齿，十分漂亮，因此有许多王子和富家公子，常带来无量宝物和钱财向她求婚，但都未谈成。公主在十六岁那年，忽然染上恶性癞病。病情传出以后，不但求婚者退避三舍，不提婚事，就连平日最疼爱她的父王与母后，也都因此不再来探问她。
公主由于饱受病苦的折磨，和世人的歧视与冷落，感到很伤心，于是独自离开王宫，躲入渺无人迹之大雪山的山洞里，殷勤礼拜观世音菩萨，祈祷菩萨解除她身心所受的痛苦。她每天除了吃一些野草外，其余的时间，均不停的礼拜观世音菩萨。这样经过了十二年，有一天，她在礼拜菩萨时，忽然见到观世音菩萨伫立在面前，一时身心感到无比清凉，癞病遂即痊愈。
此时，她启白观世音菩萨说：“我见过许多伤天害理，倚权仗势，包藏祸心，怙恶不悛的野蛮众生，其恶劣之程度，恐怕连菩萨都救不了他。请问菩萨，若要救渡这些人，到底有何办法呢？”菩萨回答说：“我救渡众生的方法有很多种，每一种都是随众生的需要而显现出来的。”
菩萨说完话之后，立刻变成十一面观音，并将最灵感的密法传授给她。菩萨嘱咐说：“末法众生根性低劣，刚强难调，这个密法是救渡他们最好的法门。今后你可以用此密法，去救这些不容易救渡的众生。”
菩萨说毕，化一道白光，瞬间消失于空中。
公主受到观世音菩萨的加持，获得大成就后，即刻返回家乡。家乡附近的人见了，啧啧称奇，觉得她不但神奇般地医好难治恶疾，同时还显得容光焕发，比以前更美丽，更动人，因此又有许多年轻人前来求婚。然而此时的公主，早已悟出世间无常，污秽痛苦，遂毅然决然地放弃所拥有的荣华富贵，出家为比丘尼。后来她以十一面观音的密法，救渡了无量无边的众生，成为十一面观音密法的第一代传承祖师。西藏人称她为“比丘玛巴摩”。如今整个西藏和印度，几乎没有人不知道，这位“比丘玛巴摩”（华比丘尼）大成就者的大名。
此外，色惹下院又供奉一尊戒香释迦牟尼佛圣像；色惹吉寺供奉一尊会说话的马头明王；密宗院供奉一尊会说话的缘拉绒尊者之圣像（十六罗汉之一）。寺中并藏有甘珠、敦珠大藏经等十万本以上的法本。
嘎登寺、哲绷寺和色惹寺，号称藏中三大寺，它不啻是弘扬大师教法的地方，更是全西藏的文化中心。
诗曰：
色惹嘎登及哲绷，世称根本三坛城；
慈心怙主留神迹，密院传承大法精。
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